Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3GL2Q99962 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3GL2Q99962 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3GL2Q99962 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms