Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3AQ99856 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID3AQ99856 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms