Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTRQ99707 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTRQ99707 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRQ99707 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRQ99707 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRQ99707 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTRQ99707 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTRQ99707 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTRQ99707 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTRQ99707 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTRQ99707 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTRQ99707 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTRQ99707 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTRQ99707 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRQ99707 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTRQ99707 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRQ99707 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRQ99707 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRQ99707 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTRQ99707 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTRQ99707 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MTRQ99707 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTRQ99707 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRQ99707 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRQ99707 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRQ99707 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRQ99707 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTRQ99707 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRQ99707 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTRQ99707 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms