Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITX2Q99697 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms