Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGMNQ99538 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGMNQ99538 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms