Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN3Q96TC7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN3Q96TC7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RMDN3Q96TC7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RMDN3Q96TC7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN3Q96TC7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN3Q96TC7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms