Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ARXQ96QS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARXQ96QS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms