Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPALINQ96PE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPALINQ96PE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms