Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSMCE3Q96MG7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NSMCE3Q96MG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms