Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC74BQ96LY2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC74BQ96LY2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms