Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf72Q96LT7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf72Q96LT7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms