Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPGRIP1Q96KN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms