Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK5RAP3Q96JB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms