Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSL1Q96IY1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSL1Q96IY1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSL1Q96IY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms