Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH4

TMEM169, Transmembrane protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM169Q96HH4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM169Q96HH4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM169Q96HH4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM169Q96HH4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms