Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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RNF185Q96GF1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RNF185Q96GF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RNF185Q96GF1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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RNF185Q96GF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RNF185Q96GF1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RNF185Q96GF1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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