Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MRPL48Q96GC5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL48Q96GC5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms