Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPL1Q96FJ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STAMBPL1Q96FJ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms