Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TVP23CQ96ET8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms