Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG4CQ96DT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG4CQ96DT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG4CQ96DT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms