Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VWCEQ96DN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VWCEQ96DN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWCEQ96DN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms