Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBGCP3Q96CW5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBGCP3Q96CW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms