Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EME1Q96AY2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms