Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS33AQ96AX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms