Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKL1Q969V6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MKL1Q969V6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKL1Q969V6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms