Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC10Q969S8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms