Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMARCE1Q969G3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMARCE1Q969G3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms