Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATOH1Q92858 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATOH1Q92858 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATOH1Q92858 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms