Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB13Q92826 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB13Q92826 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB13Q92826 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB13Q92826 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB13Q92826 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB13Q92826 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB13Q92826 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB13Q92826 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB13Q92826 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms