Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A6Q92581 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A6Q92581 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms