Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM9SF4Q92544 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TM9SF4Q92544 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms