Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNKSR2Q8WXI2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNKSR2Q8WXI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNKSR2Q8WXI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms