Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATL1Q8WXF7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL1Q8WXF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL1Q8WXF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms