Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSKUQ8WUA8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TSKUQ8WUA8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms