Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPBAR1Q8TDU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPBAR1Q8TDU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBAR1Q8TDU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms