Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCER1Q8TC90 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCER1Q8TC90 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCER1Q8TC90 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms