Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP9Q8TA86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms