Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ8

CDC26, Anaphase-promoting complex subunit CDC26, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC26Q8NHZ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC26Q8NHZ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC26Q8NHZ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms