Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEDD1Q8NHV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEDD1Q8NHV4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms