Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATL2Q8NHH9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATL2Q8NHH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATL2Q8NHH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms