Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM58Q8NG06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM58Q8NG06 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM58Q8NG06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms