Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NBEAQ8NFP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NBEAQ8NFP9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NBEAQ8NFP9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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