Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSNK2A3Q8NEV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSNK2A3Q8NEV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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