Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HIPK4Q8NE63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK4Q8NE63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms