Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNNM3Q8NE01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms