Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM35BQ8NCS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM35BQ8NCS4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM35BQ8NCS4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms