Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FSIP1Q8NA03 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FSIP1Q8NA03 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FSIP1Q8NA03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms