Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC89Q8N998 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC89Q8N998 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC89Q8N998 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms