Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NINQ8N4C6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NINQ8N4C6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NINQ8N4C6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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