Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME8Q8N427 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NME8Q8N427 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NME8Q8N427 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms